Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Zeb2Q9R0G7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zeb2Q9R0G7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms