Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Six6Q9QZ28 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Six6Q9QZ28 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Six6Q9QZ28 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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