Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmeff2Q9QYM9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmeff2Q9QYM9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmeff2Q9QYM9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmeff2Q9QYM9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmeff2Q9QYM9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmeff2Q9QYM9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmeff2Q9QYM9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmeff2Q9QYM9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmeff2Q9QYM9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmeff2Q9QYM9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmeff2Q9QYM9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmeff2Q9QYM9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmeff2Q9QYM9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmeff2Q9QYM9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmeff2Q9QYM9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmeff2Q9QYM9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmeff2Q9QYM9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmeff2Q9QYM9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmeff2Q9QYM9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmeff2Q9QYM9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmeff2Q9QYM9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmeff2Q9QYM9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmeff2Q9QYM9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmeff2Q9QYM9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmeff2Q9QYM9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms