Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Bcl11aQ9QYE3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Bcl11aQ9QYE3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Bcl11aQ9QYE3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Bcl11aQ9QYE3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Bcl11aQ9QYE3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Bcl11aQ9QYE3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Bcl11aQ9QYE3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Bcl11aQ9QYE3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms