Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tomm40Q9QYA2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tomm40Q9QYA2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tomm40Q9QYA2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tomm40Q9QYA2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tomm40Q9QYA2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tomm40Q9QYA2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tomm40Q9QYA2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tomm40Q9QYA2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tomm40Q9QYA2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tomm40Q9QYA2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tomm40Q9QYA2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tomm40Q9QYA2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tomm40Q9QYA2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tomm40Q9QYA2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tomm40Q9QYA2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tomm40Q9QYA2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tomm40Q9QYA2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tomm40Q9QYA2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tomm40Q9QYA2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tomm40Q9QYA2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tomm40Q9QYA2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tomm40Q9QYA2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tomm40Q9QYA2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tomm40Q9QYA2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms