Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ6

Slco1a1, Solute carrier organic anion transporter family member 1A1, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1a1Q9QXZ6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1a1Q9QXZ6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1a1Q9QXZ6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1a1Q9QXZ6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1a1Q9QXZ6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1a1Q9QXZ6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1a1Q9QXZ6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1a1Q9QXZ6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1a1Q9QXZ6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1a1Q9QXZ6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1a1Q9QXZ6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1a1Q9QXZ6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1a1Q9QXZ6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1a1Q9QXZ6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1a1Q9QXZ6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1a1Q9QXZ6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1a1Q9QXZ6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1a1Q9QXZ6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1a1Q9QXZ6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1a1Q9QXZ6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1a1Q9QXZ6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1a1Q9QXZ6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1a1Q9QXZ6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slco1a1Q9QXZ6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms