Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms