Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmQ9QXG2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmQ9QXG2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms