Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Clca3a1Q9QX15 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca3a1Q9QX15 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms