Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWZ1

Rad1, Cell cycle checkpoint protein RAD1, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad1Q9QWZ1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad1Q9QWZ1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad1Q9QWZ1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad1Q9QWZ1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad1Q9QWZ1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad1Q9QWZ1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad1Q9QWZ1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad1Q9QWZ1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad1Q9QWZ1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms