Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms