Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Reep6Q9JM62 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Reep6Q9JM62 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Reep6Q9JM62 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Reep6Q9JM62 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Reep6Q9JM62 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Reep6Q9JM62 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Reep6Q9JM62 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Reep6Q9JM62 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Reep6Q9JM62 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Reep6Q9JM62 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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