Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Nectin3Q9JLB9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nectin3Q9JLB9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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