Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms