Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msgn1Q9JK54 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms