Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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