Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alyref2Q9JJW6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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