Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms