Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MkksQ9JI70 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MkksQ9JI70 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms