Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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