Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ51

Vmn1r47, Vomeronasal type-1 receptor 47, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r47Q9EQ51 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Vmn1r47Q9EQ51 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Vmn1r47Q9EQ51 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Vmn1r47Q9EQ51 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Vmn1r47Q9EQ51 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Vmn1r47Q9EQ51 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Vmn1r47Q9EQ51 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Vmn1r47Q9EQ51 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Vmn1r47Q9EQ51 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Vmn1r47Q9EQ51 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Vmn1r47Q9EQ51 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Vmn1r47Q9EQ51 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r47Q9EQ51 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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