Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlr1Q9EPQ1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Tlr1Q9EPQ1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Tlr1Q9EPQ1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Tlr1Q9EPQ1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Tlr1Q9EPQ1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Tlr1Q9EPQ1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Tlr1Q9EPQ1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Tlr1Q9EPQ1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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