Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rp2Q9EPK2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rp2Q9EPK2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms