Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmg20aQ9DC33 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms