Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde1Q9DBZ9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms