Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fundc1Q9DB70 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fundc1Q9DB70 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms