Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Pop5Q9DB28 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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Pop5Q9DB28 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pop5Q9DB28 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms