Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnn3Q9DAW9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn3Q9DAW9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn3Q9DAW9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn3Q9DAW9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn3Q9DAW9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn3Q9DAW9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn3Q9DAW9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn3Q9DAW9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn3Q9DAW9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn3Q9DAW9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn3Q9DAW9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn3Q9DAW9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnn3Q9DAW9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms