Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK2

Pacrg, Parkin coregulated gene protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PacrgQ9DAK2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PacrgQ9DAK2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PacrgQ9DAK2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms