Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc89Q9DA73 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms