Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2e2Q9D902 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms