Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm5Q9D806 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms