Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms