Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pfn4Q9D6I3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms