Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PudpQ9D5U5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms