Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
4930449I24RikQ9D5E3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930449I24RikQ9D5E3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms