Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Zcchc13Q9D548 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms