Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam90a1bQ9D4F3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms