Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms