Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bcas2Q9D287 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bcas2Q9D287 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bcas2Q9D287 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bcas2Q9D287 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bcas2Q9D287 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bcas2Q9D287 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bcas2Q9D287 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bcas2Q9D287 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bcas2Q9D287 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms