Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chordc1Q9D1P4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms