Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx17Q9D0I4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms