Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc47Q9D024 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc47Q9D024 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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