Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cmss1Q9CZT6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms