Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms