Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYB0

Trim13, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM13, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim13Q9CYB0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim13Q9CYB0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms