Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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