Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm8Q9CXT6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kdm8Q9CXT6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms