Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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RpainQ9CWY9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RpainQ9CWY9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms