Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms